В процессе становления Этнологической экспертизы с 1999 года многие оценочные либо исследовательские организации пытались заниматься работами в данной сфере. Но менялись законы, становились всё более ясными предмет и объект таких исследований, их процедура и стало очевидно, что силами одной, даже крупной научной организации подобную экспертизу не провести.
Любое этнологическое исследование, в том числе Этнологическую экспертизу реализуют пять групп ученых. Каждая из групп имеет своих координаторов. Готовые отчеты групп рассматривает «Научная комиссия по этнологической экспертизе», в которую входят представители всех пяти исследовательских групп. Результатом любого этнологического исследования, в том числе и собственно Этнологической экспертизы является «Отчет об этнологической экспертизе» составленный ответственным секретарем данной комиссии и утвержденный большинством голосов членов комиссии. Оригинал отчета должен быть заверен подписью председателя комиссии.
В настоящий момент наибольшим опытом в проведении этнологических исследований в РФ располагает ВНК «ЭТНОГИС». В его составе работают пять независимых ВНК (временных научных коллективов)
ВНК «Этнографический блок ЭТНОГИС» Координатор Новикова Н.И. (ИАЭ РАН им. Н.Н.Миклухо-Маклая)
ВНК «Этноэкономический блок ЭТНОГИС» Координаторы Симонова И.В. (Академия Наук Республики Саха (Якутия) и Потравный И.М. (РЭУ им.Г.В.Плеханова)
ВНК «Социально-Антропологический блок ЭТНОГИС» Координатор Симонова В.В. (Центр Арктических и Сибирских исследований ФНИСЦ РАН) также в ВНК входят научные сотрудники МАЭ РАН (Кунсткамера) и НИУ ВШЭ
ВНК «Экологический блок ЭТНОГИС» Координаторы Кирпотин С.Н. (Томский Государственный Университет) и Балдеску Е.В., также в ВНК входят научные сотрудники МГУ им. Ломоносова
ВНК «Правовой блок ЭТНОГИС» Координаторы Слепцов А.И (СВФУ им. Аммосова), также в ВНК входят научные сотрудники Института гуманитарных исследований и проблем малочисленных народов Севера СО РАН, Тюменского Государственного Университета, Центра Арктических и Сибирских исследований ФНИСЦ РАН